Séminaire du LIF
Jeudi 24 mars à 14h - Luminy, Amphi 12
Céline Fouard
Projet Épidaure, INRIA Sophia Antipolis
Extraction de paramètres morphométriques pour l'étude du réseau micro-vasculaire cérébral
Nous nous proposons de fournir des outils logiciels aux anatomistes et neuro-anatomistes afin de permettre une analyse tridimensionnelle quantitative des réseaux micro-vasculaires cérébraux. Cette analyse demande des images de très haute résolution (permettant de tenir compte des plus petits capillaires), mais aussi des images couvrant une surface du cortex suffisamment large pour être statistiquement significative. Comme elle ne peut être acquise en une seule fois, nous proposons de paver la surface à imager de plusieurs petites images et de créer ainsi une grande mosaïque d'images.
Cette étude quantitative nécessite l'extraction des lignes centrales et une estimation des diamètres des vaisseaux. La géométrie discrète offre un cadre de travail rapide et puissant pour ce type de calculs. Le calcul des distances de chanfrein à l'intérieur des vaisseaux nous permet en effet à la fois de guider un algorithme de squelettisation et de calculer, a posteriori, les rayons des différents vaisseaux.
Les algorithmes présentés ont été intégrés dans le logiciel commercial Amira et sont utilisés en routine par les chercheurs de l'unité U455 de l'INSERM.
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